Herramientas bioinformáticas para Secuenciación Masiva de ADN 2022
El Laboratorio Nacional de Apoyo Tecnológico a las Ciencias
Genómicas, a través de la Unidad Universitaria de Secuenciación Masiva y
Bioinformática, con sede en el Instituto de Biotecnología de la UNAM, con el soporte de la Red Mexicana de Bioinformática, tenemos el placer de invitarlos a este curso de HERRAMIENTAS BIOINFORMÁTICAS PARA SECUENCIACIÓN MASIVA DE ADN ENERO 2022.
OBJETIVOS
- Proporcionar a los asistentes los conceptos y habilidades básicas de herramientas bioinformáticas para el manejo y análisis de datos genómicos y transcriptómicos.
- Proporcionar las bases metodológicas para el diseño experimental en estas áreas.
- Proporcionar las bases suficientes para interpretar resultados de análisis de datos y generar información de utilidad.
RECEPCIÓN DE SOLICITUDES
Se recibirán solicitudes en nuestro portal de cursos SAC (Sistema de Administración de Cursos) a partir del martes 12 de Octubre y hasta cubrir el cupo máximo de personas.
Todas las solicitudes que se reciban posterior a cubrir el cupo quedarán en lista de espera, favor de enviar correo a: curso_uusmb@ibt.unam.mx
- Para inscribirte al curso ingresa al siguiente sitio : SAC (Sistema de Administración de Cursos)
- Después de registrarte( si eres nuevo usuario) o bien haber iniciado sesión debes elegir el curso al que deseas inscribirte.
CONTENIDO GENERAL DEL CURSO
- Sistema Operativo UNIX: revisión de comandos útiles para para la manipulación y análisis de archivos por medio de línea de comandos (sin gráficos), con el fin de optimizar el procesamiento de archivos grandes.
- Utilización de información existente en las bases de datos del NCBI (National Center for Biotechnology Information).
- Lenguaje de programación R: para realizar análisis estadístico y generar gráficas con información sintetizada y de calidad para ser incluida en publicaciones.
- Introducción a las tecnologías de Secuenciación Masiva.
- Control de calidad, filtrado y limpieza de datos, alineamiento y manejo de bamtools y samtools.
- Ensamblado de genomas y transcriptomas.
- Predicción y anotación de genes.
- Ensamblado metagenómico
- Análisis de expresión diferencial de genes o transcritos.
PERFIL DEL PÚBLICO ASISTENTE:
El Curso está dirigido a público con conocimientos en biología y/o
afines, con interés en biología molecular, genómica y bioinformática.
Se extenderá constancia de participación a los asistentes que concluyan el proceso de inscripción, realicen el pago correspondiente y asistan, como mínimo, al 80% de las clases.
Es necesario contar con equipo de cómputo para tomar los cursos, ya que se utilizará como terminal para conectarse a nuestro servidor de cómputo.
El sistema operativo del equipo de cómputo puede ser cualquier
distribución de Linux, MacOS, o Windows, este último con algún
emulador de terminal, como MobaXterm (en windows 10 existe una versión
de terminal llamada Power Shell).
FECHAS DEL CURSO
- El curso se llevará a cabo en formato online
- del lunes 17 al viernes 28 de ENERO del 2022
- de 10:00 a.m a 18:00 pm (Centro de México, GMT-5 ), cubriendo un total de 70 hrs en 10 días.
INGRESA A:
