Introducción a Unix
Datos generales
Código: Intro-Unix
Duración: 2.5 horas
Nivel: Básico
Idioma: Español
Fecha: 30 de septiembre de 2022
Duración: 2.5 horas
Nivel: Básico
Idioma: Español
Fecha: 30 de septiembre de 2022
Horario: 16:00 a 18:30 (centro de México)
Modalidad: Online
Descripción:
Trabajar en sistemas Unix es una habilidad básica en bioinformática. Los sistemas basados en Unix nos permiten manejar de manera eficiente la gran cantidad de datos con los que trabajamos (principalmente aquellos provenientes de experimentos de secuenciación masiva), ejecutar como desarrollar programas bioinformáticos, trabajar en servidores remotos y mantener controles de versión, por destacar algunas funcionalidades.
En este curso aprenderemos desde cero a:
- Familiarizarnos con sistemas tipo Unix y la línea de comando.
- Conectarnos a servidores remotos.
- Entender la estructura del sistema de archivos en Unix.
- Propiedades y permisos de los archivos.
- Sintaxis básica de comandos en Unix y manual.
- Comandos de operaciones con archivos (leer, escribir, editar, copiar, mover, etc.)
- Comandos de búsqueda de patrones en nuestros archivos.
- Composición de comandos.
- Redireccionar salidas.
- Mover archivos de servidores remotos a computadora local.
Pre-requisitos:
- Conexión estable a internet y cuenta de zoom.
- Computadora: no es posible realizar el curso desde teléfonos ni desde tablets.
- Si tu sistema operativo es Windows deberás instalar el programa mobaXterm. El manual de instalación y una sesión de asesoría se ofrecerán una vez registrados en el evento.
- Si tu sistema operativo es Linux o macOS, puedes unirte a la sesión de asesoría para ubicar tu terminal.
Para quién va dirigido este mini curso:
Miembros de la RMB interesados en aprender a trabajar en Unix desde cero.
Detalles del evento:
- El evento será gratuito y exclusivo para miembros de la RMB.
- Las instrucciones de acceso serán enviadas el día del evento.
Actividades:
- 15:45 a 16:00: Conéctate a Zoom y configura tu micrófono
- 16:00 a 16:05: Introducción de parte de la Red Mexicana de Bioinformática
- 16:05 a 16:15: Código de conducta y cómo usar la plataforma de Zoom
- 16:15 a 18:30: Actividad del curso
Organizadores:
Formulario de registro:
Reseña de los instructores
M. en C. Dulce Irene Valdivia Martínez. Estudió parcialmente la licenciatura en Computación en la Universidad de Guanajuato - CIMAT. Egresó de la licenciatura en Biología en la Universidad Autónoma de Aguascalientes, donde su trabajo de titulación consistió en el desarrollo de un método computacional para identificar genes de transferencia horizontal. Es maestra en ciencias en Biología Integrativa por el CINVESTAV-Irapuato, donde estudió el impacto que tiene la conformación tridimensional del genoma en la evolución de los genes codificantes. Ha realizado varias estancias de investigación, entre las que destacan: el Instituto Max Planck de Matemáticas para las Ciencias, la Universidad Libre de Berlín y el Instituto Leibniz para el Envejecimiento. Ha impartido clases de programación desde 2007 y ha participado como ayudante en cursos tanto nacionales e internacionales de bioinformática desde 2018. Es miembro fundador de la Red Mexicana de Bioinformática, fungiendo actualmente como integrante del nodo de membresías. Hoy en día trabaja como investigador asociado en el Laboratorio de Bioinformática y Redes Compleja (CINVESTAV-Irapuato), analizando muestras metagenómicas de microorganismos productores de biogás.
Nombre de los ayudantes:
Emiliano Juárez López - 314050649@ciencias.unam.mx
